008240612s2023      us  |||||||||||||||c||eng  d
■001000016931782
■00520240214100117
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798379603403
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI30423018
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a574
■1001  ▼aHillis,  Alissandra  L.  .▼0(orcid)0000-0002-6667-1291
■24510▼aExploiting  Signaling  Signatures  in  Triple-Negative  Breast  Cancer  to  Identify  Targetable  Vulnerabilities▼h[electronic  resource]
■260    ▼a[S.l.]:▼bHarvard  University.  ▼c2023
■260  1▼aAnn  Arbor  :▼bProQuest  Dissertations  &  Theses,  ▼c2023
■300    ▼a1  online  resource(234  p.)
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  84-12,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Toker,  Alex.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--Harvard  University,  2023.
■506    ▼aThis  item  must  not  be  sold  to  any  third  party  vendors.
■520    ▼aTriple-negative  breast  cancer  (TNBC)  is  an  aggressive  and  heterogeneous  disease  with  the  worst  five-year  survival  rate  of  all  breast  cancer  subtypes.  The  standard  of  care  for  TNBC  is  chemotherapy,  but  not  all  patients  respond  to  chemotherapy,  and  responders  often  recur  with  chemotherapy-resistant  disease.  There  are  limited  targeted  therapy  options  for  TNBC,  in  part,  because  tumor  heterogeneity  has  precluded  the  identification  of  druggable  drivers  of  disease.  However,  TNBC  has  several  common  genetic  alterations,  including  hyperactivation  of  the  phosphoinositide  3-kinase  (PI3K)/AKT  signaling  pathway,  epidermal  growth  factor  receptor  (EGFR)  overexpression,  and  protein  tyrosine  phosphatase  (PTP)  loss.  In  this  thesis,  we  exploit  the  signaling  signatures  of  TNBC,  using  two  distinct  approaches,  to  identify  targetable  vulnerabilities.In  the  first  approach,  we  performed  a  genome-wide  negative  selection  CRISPR/Cas9  screen  with  PI3K/AKT  inhibitors  in  TNBC  cells  and  identified  synthetic  lethality  between  PI3K/AKT  pathway  inhibition  and  disruption  of  cholesterol  homeostasis  genes.  AKT  inhibitors  synergized  with  statins,  cholesterol  biosynthesis  inhibitors,  to  induce  apoptotic  cell  death  in  TNBC  cells  but  not  in  estrogen  receptor  (ER)-  positive  breast  cancer  cells  or  non-tumorigenic  breast  epithelial  cells.  We  showed  that  TNBC  cells  are  hypersensitive  to  statins  due  to  dysregulated  cholesterol  homeostasis,  which  prevents  statin-induced  upregulation  of  HMG-CoA  reductase  (HMGCR),  a  rate-limiting  enzyme  in  cholesterol  biosynthesis.  This  work  proposes  a  novel  combination  treatment  strategy  for  TNBC,  combining  a  potent  statin,  pitavastatin,  with  AKT  inhibition. In  the  second  approach,  we  characterized  the  metabolic  tyrosine  phosphoproteome  in  TNBC,  driven  by  EGFR  overexpression  and  PTP  loss.  We  performed  parallel  phosphoproteomics  and  metabolomics  in  triple-negative,  non-tumorigenic  mammary  epithelial  cells,  followed  by  an  integrated  analysis  of  the  two  datasets.  This  analysis  identified  both  previously  characterized  tyrosine  phosphorylation  (pTyr)  sites  and  uncharacterized  pTyr  sites  on  metabolic  enzymes.  We  developed  a  CRISPR  interference  (CRISPRi)  system  to  further  define  the  functional  consequences  of  the uncharacterized  pTyr  sites.  By  combining  metabolomics  with  phosphoproteomics,  we  propose  a  method  to  globally  characterize  the  functional  significance  of  the  metabolic  tyrosine  phosphoproteome,  which  can  be  used  to  identify  functionally  relevant  targets  in  TNBC.  Altogether,  this  thesis  identifies  a  novel  targeted  therapy  combination  for  TNBC  and  proposes  multiple  methods  by  which  to  functionally  characterize  TNBC  and  identify  druggable  targets.
■590    ▼aSchool  code:  0084.
■650  4▼aCellular  biology.
■650  4▼aOncology.
■650  4▼aBiochemistry.
■653    ▼aCancer
■653    ▼aCholesterol
■653    ▼aHeterogeneous  disease
■653    ▼aPhosphoproteome
■653    ▼aMetabolic  tyrosine
■690    ▼a0379
■690    ▼a0992
■690    ▼a0487
■71020▼aHarvard  University▼bMedical  Sciences.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g84-12B.
■773    ▼tDissertation  Abstract  International
■790    ▼a0084
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2023
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T16931782▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.
■980    ▼a202402▼f2024