008240612s2023      us  |||||||||||||||c||eng  d
■001000016931567
■00520240214100045
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798380313056
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI30314528
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a580
■1001  ▼aWickell,  David  Allen.▼0(orcid)0000-0002-1389-6681
■24512▼aA  Fistful  of  Genomes:  Adventures  in  Comparative  Genomics  of  Seed-Free  Plants▼h[electronic  resource]
■260    ▼a[S.l.]:▼bCornell  University.  ▼c2023
■260  1▼aAnn  Arbor  :▼bProQuest  Dissertations  &  Theses,  ▼c2023
■300    ▼a1  online  resource(367  p.)
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  85-03,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Li,  Fay-Wei.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--Cornell  University,  2023.
■506    ▼aThis  item  must  not  be  sold  to  any  third  party  vendors.
■520    ▼aIn  the  modern  era  of  plant  biology,  high-quality  reference  genome  assemblies  represent  a  foundational  first  step  to  many  studies.  They  allow  chromosome  level  structural  analysis,  characterization  of  various  types  of  repetitive  sequence,  and  identification  of  cis  regulatory  elements.  Additionally,  they  improve  many  other  types  of  research  including  functional  annotation  of  genes  and  gene  family  analysis.  The  proliferation  of  relatively  cheap  high  throughput  sequencing  and  powerful  computational  resources  has  resulted  in  a  surge  of  such  assemblies  being  produced  across  the  tree  of  life.  However,  the  majority  of  this  effort  has  been  restricted  to  a  relatively  narrow  range  of  phylogenetic  diversity,  focusing  on  a  handful  of  agriculturally  important  groups.  This  has  resulted  in  a  significant  bias  in  our  understanding  of  many  fundamental  concepts  and  processes  such  as  plant  genome  structure  and  organization,  regulation  of  gene  expression,  and  whole  genome  duplication,  to  name  a  few.  My  doctoral  research  seeks  to  expand  our  understanding  of  plant  biology  using  a  combination  of  genomic  and  transcriptomic  data  from  ferns  and  lycophytes.  I  have  utilized  high  quality  genome  assemblies  from  multiple  species  of  ferns  and  lycophytes  to  gain  unprecedented  insight  into  processes  and  downstream  effects  of  whole  genome  duplication  and  subsequent  diploidization  in  seed-free  plants.  In  addition,  I  have  studied  the  convergent  evolution  of  aquatic  CAM  in  the  lycophyte  genus  Isoetes  using  a  combination  of  genomic  and  transcriptomic  data.  Lastly,  I  conducted  species  and  population  level  phylogenetic  analysis  of  Isoetes  appalachiana,  a  widespread  allopolyploid,  to  investigate  the  establishment  of  polyploid  lineages  and  quantify  subsequent  gene  flow  between  them.  My  research  is  diverse,  spanning  multiple  disciplines  as  well  as  multiple  phylogenetic  lineages  and  ultimately  represents  a  valuable  resource  for  future  forays  into  comparative  genomics  and  transcriptomics  of  vascular  plants.
■590    ▼aSchool  code:  0058.
■650  4▼aPlant  sciences.
■650  4▼aBioinformatics.
■650  4▼aGenetics.
■653    ▼aGenomics
■653    ▼aPteridophytes
■653    ▼aVascular  plants
■653    ▼aPlant  biology
■653    ▼aSeed-free  plants
■690    ▼a0479
■690    ▼a0369
■690    ▼a0715
■71020▼aCornell  University▼bPlant  Biology.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g85-03B.
■773    ▼tDissertation  Abstract  International
■790    ▼a0058
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2023
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T16931567▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.
■980    ▼a202402▼f2024