008240612s2023      us  |||||||||||||||c||eng  d
■001000016931809
■00520240214100121
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798379754099
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI30424146
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a574
■1001  ▼aHua,  Xia.
■24510▼aSystematic  Analysis  of  Small  RNAs  and  Long  Non-Coding  RNAs  in  the  Context  of  Abscisic  Acid-Dependent  Abiotic  Stress  Responses  in  Arabidopsis▼h[electronic  resource]
■260    ▼a[S.l.]:▼bUniversity  of  Pennsylvania.  ▼c2023
■260  1▼aAnn  Arbor  :▼bProQuest  Dissertations  &  Theses,  ▼c2023
■300    ▼a1  online  resource(104  p.)
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  84-12,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Gregory,  Brian.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--University  of  Pennsylvania,  2023.
■506    ▼aThis  item  must  not  be  sold  to  any  third  party  vendors.
■520    ▼aon-coding  RNAs  (lncRNAs)  that  exceed  200  nucleotides.  In  Arabidopsis  thaliana,  smRNAs  are  typically  generated  from  long  double-stranded  RNA  molecules  produced  by  one  of  the  six  RNA-dependent  RNA  Polymerase  (RDR)  proteins,  while  lncRNAs  are  transcribed  by  RNA  polymerase  II  and  may  be  regulated  by  transcription  factors  (TFs).  These  ncRNAs  play  crucial  roles  in  stress  tolerance  and  can  regulate  the  plant  hormone  abscisic  acid  (ABA)  signaling  pathway,  which  is  a  major  regulator  of  plant  responses  to  abiotic  stressors.  However,  there  are  gaps  in  our  understanding  regarding  the  regulation  of  smRNA  biogenesis  that  is  mediated  by  RDRs,  the  potential  role  of  RDR-dependent  smRNAs  in  plant  response  to  abiotic  stresses,  and  whether  lncRNAs  whose  transcription  is  regulated  by  ABA-triggered  transcription  factors  binding  sites  are  required  for  proper  plant  response  to  the  plant  hormone  ABA.  To  address  these  questions,  we  first  performed  a  global  genomic  analysis  to  identify  the  first  known  substrates  for  Arabidopsis  thaliana  RDR3,  4,  and  5,  which  were  not  previously  defined.  We  also  identified  new  substrates  for  RDR1,  2,  and  6,  as  well  as  the  co-factors  for  RDR2  and  RDR6,  RNA-DIRECTED  DNA  METHYLATION  12  (RDM12)  and  SUPRESSOR  OF  GENE  SILENCING  3  (SGS3),  respectively.  Our  findings  indicate  that  SGS3  substrates  are  not  limited  to  those  exclusively  utilized  by  RDR6,  but  that  this  protein  seems  to  serve  as  a  more  general  co-factor  for  all  plant  RDR  proteins.  Furthermore,  we  discovered  that  RDR6  and  SGS3  are  involved  in  silencing  transcripts  associated  with  abiotic  stresses,  including  ABA  response,  water  deprivation,  and  salt  stress.  Secondly,  we  screened  lncRNAs  potentially  regulated  by  ABA-induced  TFs  under  exogenous  ABA  treatment,  and  found  that  when  some  of  these  lncRNAs  are  mutated  the  resulting  mutant  plants  exhibited  hyposensitive/hypersensitive  phenotypes  to  this  hormone,  indicating  their  potential involvement  in  regulating  ABA  responses  in  Arabidopsis  thaliana.  Deciphering  the  molecular  mechanisms  underlying  abiotic  stress  responses  in  plants  is  important,  since  this  knowledge  can  guide  us  to  enhance  crop  survival  in  increasingly  extreme  environments.  Our  study  reveals  previously  unexplored  mechanisms  in  the  RDR6/SGS3-dependent  RNA  silencing  pathway  and  unknown  functions  of  lncRNAs  in  plant  abiotic  stress  responses.
■590    ▼aSchool  code:  0175.
■650  4▼aBiology.
■650  4▼aPhysiology.
■650  4▼aPlant  sciences.
■650  4▼aGenetics.
■653    ▼aFenomic  analysis
■653    ▼aArabidopsis  thaliana
■653    ▼aPlant  abiotic  stress
■653    ▼aPlant  response
■653    ▼aRDR  proteins
■690    ▼a0306
■690    ▼a0479
■690    ▼a0369
■690    ▼a0719
■71020▼aUniversity  of  Pennsylvania▼bBiology.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g84-12B.
■773    ▼tDissertation  Abstract  International
■790    ▼a0175
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2023
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T16931809▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.
■980    ▼a202402▼f2024