MARC

 008240612s2021      us  |||||||||||||||c||eng  d
■001000016931872
■00520240214100319
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798380619134
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI28776902
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a574
■1001  ▼aJimenez  Barrios,  Rosa  A.
■24510▼aBiogeography  and  Evolution  of  Montane  Birds  Across  Nuclear  Central  America  =▼bBiogeografia  y  evolucion  de  aves  de  Montana  en  Centroamerica  nuclear▼h[electronic  resource]
■260    ▼a[S.l.]:▼bUniversity  of  California,  Berkeley.  ▼c2021
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2021
■300    ▼a1  online  resource(216  p.)
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  85-04,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Bowie,  Rauri  C.  K.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--University  of  California,  Berkeley,  2021.
■506    ▼aThis  item  must  not  be  sold  to  any  third  party  vendors.
■520    ▼aThis  dissertation  aims  to  understand  the  patterns  and  processes  involved  in  the  origin,  maintenance,  and  diversification  of  montane  birds  in  Nuclear  Central  America.  Nuclear  Central  America,  the  region  between  the  Isthmus  of  Tehuantepec  and  the  Nicaraguan  Depression,  is  an  understudied  tropical,  but  highly  biodiverse  region.  We  assemble  genetic,  morphological,  and  climatic  datasets  to  uncover  biogeographic  and  evolutionary  processes  across  a  spatial  and  temporal  continuum.  We  report  genomic  data  from  850  individuals  representing  ten  bird  species  from  the  mountains  of  Nuclear  Central  America,  and  using  these  data  we  detect  several  new  biogeographic  breaks.  This  dissertation  constitutes  the  first  study  incorporating  genomic  data  to  understand  evolutionary  processes  underpinning  bird  diversity  in  Nuclear  Central  America. Chapter  1  reveals  that  historical  and  contemporary  processes  have  fueled  in  situ  diversification  within  Nuclear  Central  America.  We  study  Lampornis  viridipallens  and  L.  sybillae  integrating  phylogeography,  landscape  genetics,  ecological  niche  modeling,  and  morphological  measurements  to  understand  diversification  across  the  species-population  interface.  Mitochondrial  and  microsatellite  data  indicate  that  L.  viridipallens  and  L.  sybillae  diverged  in  allopatry  during  the  early  Pleistocene  on  either  side  of  the  Honduras  Depression.  This  divergence  was  followed  or  accompanied  by  ecological  niche  divergence.  Within  L.  viridipallens,  dry  valleys  that  separate  mountain  ranges  are  geographic  barriers  promoting  isolation  in  this  hummingbird  species  restricted  to  cloud  forests.  Moreover,  environmental  variables  are  much  more  critical  for  facilitating  gene  flow  and  population  connectivity  than  straight-line  geographic  distance.Chapter  2  highlights  the  importance  of  assessing  multiple  processes  to  understand  the  origin  and  maintenance  of  biodiversity,  especially  in  topographically  complex  regions  such  as  the  Neotropics.  We  investigate  the  phylogeography  and  genetic  basis  of  phenotype-genotype  discordance  in  Atlapetes  albinucha  across  its  geographic  range,  from  Mexico  to  Colombia.  We  assemble  mitochondrial  and  genomic  data  of  73  individuals,  including  the  yellow  and  gray  phenotypes  of  the  species.  Our  analyses  show  that  allopatric  divergence  results  in  high  geographic  genetic  structure.  Additionally,  we  included  two  individuals  with  intermediate  phenotypes.  Ours  is  the  first  report  of  hybridization  between  the  two  plumage  color  phenotypes.  We  describe  the  environment  where  the  barrier  between  the  yellow  and  gray  phenotypes  occurs (biogeographic  barrier  east  to  Altos  de  Chiapas).  We  find  that  high  precipitation  and  low  elevation  limit  the  geographic  range  of  both  phenotypes  and  provide  a  different  environment  in  the  hybrid  zone.  Furthermore,  our  genomic  data  suggests  UDP-glucuronosyltransferase  as  a  candidate  gene  explaining  the  presence-absence  of  yellow  color  in  the  ventral  feathers  of  A.  albinucha.Chapter  3  investigates  that  the  evolutionary  and  biogeographic  history  of  Saucerottia  hummingbirds  and  sets  the  biological  stage  for  understanding  the  genetic  basis  of  structural  color  variation  in  hummingbird  plumage.  We  integrate  mitochondrial  and  genomic  data  of  128  individuals,  including  representation  from  Mexico  to  Guyana,  to  understand  phylogenetic  relationships  and  the  geographic  distribution  of  genetic  variation.  Additionally,  we  examine  and  describe  the  physical  structure  of  rufous,  blue,  and  intermediately  colored  tail  feathers.  Our  results  demonstrate  that  shallow  divergence  and  mixed  ancestry  in  Saucerottia  provide  similar  genetic  backgrounds  across  species.  Evolutionary  labile  tail  coloration  occurs  across  multiple  species  pairs  differing  mainly  in  structural  coloration.  Geographically  detailed  sampling  within  Nuclear  Central  America  uncovers  divergence  consistent  with  the  geographic  distribution  of  tail  color  variants.  We  also  identify  various  candidate  genes  related  to  the  melanin  biosynthesis  pathway  that  may  underlie  variation  in  structural  coloration.Chapter  4  reports  that  the  current  mountain  bird  assemblage  in  Nuclear  Central  America  results  from  common  biogeographic  history  and  species  idiosyncratic  evolutionary  paths.  Through  a  comparative  phylogeographic  approach,  we  examine  mitochondrial  and  genomic  data  of  676  individuals  comprising  the  bird  species:  Lampornis  viridipallens,  L.  sybillae,  Henicorhina  leucophrys,  Basileuterus  belli,  Myioborus  miniatus,  Chlorospingus  flavopectus,  and  Arremon  brunneinucha.  Phylogenetic  analyses  support  the  role  of  Nuclear  Central  America  as  the  interconnection  between  the  avian  fauna  of  North  and  South  America.  Additionally,  high  levels  of  population  genetic  structure  among  different  mountain  ranges  within  Nuclear  Central  America  suggest  in  situ  diversification.  We  show  that  the  isolating  effect  of  the  Motagua-Polochic-Jocotan  Fault  System  is  not  homogenous  along  its  extent  and  that  the  biogeographic  barrier  east  to  Altos  de  Chiapas  is  essential  to  isolating  montane  populations  from  one  another.
■520    ▼asta  tesis  tiene  como  objetivo  comprender  los  patrones  y  procesos  involucrados  en  el  origen,  mantenimiento  y  diversificacion  de  las  aves  de  montana  de  Centroamerica  Nuclear.  Centroamerica  Nuclear,  la  region  entre  el  Istmo  de  Tehuantepec  y  la  Depresion  de  Nicaragua,  es  una  region  tropical  poco  estudiada  pero  con  una  gran  biodiversidad.  Recopilamos  datos  geneticos,  morfologicos  y  climaticos  para  descubrir  procesos  biogeograficos  y  evolutivos  a  traves  de  un  continuo  espacial  y  temporal.  Reportamos  datos  genomicos  de  850  individuos  que  representan  diez  especies  de  aves  de  las  montanas  de  Centroamerica  Nuclear  y  usando  estos  datos  detectamos  varias  barreras  biogeograficas  nuevas.  Esta  tesis  constituye  el  primer  estudio  que  incorpora  datos  genomicos  para  comprender  los  procesos  evolutivos  que  sustentan  la  diversidad  de  aves  en  Centroamerica  Nuclear.El  Capitulo  1  revela  que  procesos  historicos  y  contemporaneos  han  impulsado  la  diversificacion  in  situ  dentro  de  Centroamerica  Nuclear.  Estudiamos  a  las  especies  Lampornis  viridipallens  y  L.  sybillae  integrando  filogeografia,  genetica  del  paisaje,  modelado  de  nicho  ecologico  y  morfologia  para  comprender  la  diversificacion  en  la  interfaz  especie-poblacion.  Los  datos  mitocondriales  y  de  microsatelites  indican  que  L.  viridipallens  y  L.  sybillae  divergieron  en  alopatria  durante  el  Pleistoceno  temprano  a  ambos  lados  de  la  Depresion  de  Honduras.  Esta  divergencia  fue  seguida  o  acompanada  por  divergencia  de  nicho  ecologico.  Dentro  de  L.  viridipallens,  los  valles  secos  que  separan  las  cadenas  montanosas  son  barreras  geograficas  que  promueven  el  aislamiento  de  esta  especie  de  colibri  restringida  a  los  bosques  nubosos.  Ademas,  las  variables  ambientales  son  mucho  mas  criticas  para  facilitar  el  flujo  de  genes  y  la  conectividad  de  las  poblaciones  en  relacion  a  la  distancia  geografica.El  Capitulo  2  destaca  la  importancia  de  evaluar  multiples  procesos  para  comprender  el  origen  y  mantenimiento  de  la  biodiversidad,  especialmente  en  regiones  topograficamente  complejas  como  el  Neotropico.  Investigamos  la  filogeografia  y  la  base  genetica  de  la  discordancia  fenotipo-genotipo  en  Atlapetes  albinucha  a  lo  largo  de  su  area  de  distribucion,  desde  Mexico  hasta  Colombia.  Recopilamos  datos  mitocondriales  y  genomicos  de  73  individuos,  incluyendo  los  dos  fenotipos  de  la  especie,  amarillo  y  gris.  Nuestros  analisis  muestran  que  la  divergencia  en  alopatria  da  como  resultado  alta  estructuracion  genetica.  Ademas,  incluimos  dos  individuos  con  fenotipos  intermedios  entre  el  amarillo  y  el  gris.  Este  constituye  el  primer  reporte  de  hibridacion  entre  los  dos  fenotipos  de  coloracion  del  plumaje.  Describimos  el  ambiente  donde  ocurre  la  barrera  entre  los  fenotipos  amarillo  y  gris  (barrera  biogeografica  al  este  de  los  Altos  de  Chiapas).  Encontramos  que  la  alta  precipitacion  y  la  baja  elevacion  limitan  el  area  de  distribucion  de  ambos  fenotipos  y  a  la  vez  proporcionan  un  ambiente  diferente  en  donde  ocurre  una  zona  de  hibridacion.  Ademas,  nuestros  datos  genomicos  sugieren  que  el  gen  que  codifica  la  proteina  UDP-glucuronosiltransferasa  es  un  gen  candidato  que  explica  la  presencia-ausencia  de  color  amarillo  en  las  plumas  ventrales  de  A.  albinucha.El  Capitulo  3  investiga  la  historia  evolutiva  y  biogeografica  de  los  colibries  Saucerottia  y  establece  el  escenario  biologico  para  comprender  la  base  genetica  de  la  variacion  de  color  estructural  en  el  plumaje  de  los  colibries.  Integramos  datos  mitocondriales  y  genomicos  de  128  individuos,  incluyendo  representacion  desde  Mexico  hasta  Guyana,  para  comprender  las  relaciones  filogeneticas  y  la  distribucion  geografica  de  la  variacion  genetica.  Ademas,  examinamos  y  describimos  la  estructura  fisica  de  las  plumas  de  la  cola  de  color  rojizo,  azul  e  intermedio.  Nuestros  resultados  demuestran  que  la  divergencia  reciente  y  la  ascendencia  mixta  en  Saucerottia  proporcionan  una  base  genetica  similar  en  todas  las  especies.  La  coloracion  de  la  cola  evolutivamente  labil  ocurre  en  multiples  pares  de  especies  que  difieren  principalmente  en  la  coloracion  estructural.  El  muestreo  geograficamente  detallado  dentro  de  Centroamerica  Nuclear  muestra  divergencias  consistentes  con  la  distribucion  geografica  de  las  variantes  del  color  de  la  cola.  Tambien  identificamos  varios  genes  candidatos  relacionados  con  la  ruta  de  biosintesis  de  la  melanina,  los  cuales  pueden  ser  la  base  de  la  variacion  en  la  coloracion  estructural.El  Capitulo  4  informa  que  el  ensamble  actual  de  aves  de  montana  de  Centroamerica  Nuclear  es  el  resultado  de  una  historia  biogeografica  comun  y  de  la  evolucion  idiosincratica  de  las  especies.  Mediante  un  enfoque  filogeografico  comparativo  examinamos  datos  mitocondriales  y  genomicos  de  676  individuos  que  comprenden  las  especies  de  aves:  Lampornis  viridipallens,  L.  sybillae,  Henicorhina  leucophrys,  Basileuterus  belli,  Myioborus  miniatus,  Chlorospingus  flavopectus  y  Arremon  brunneinucha.  Los  analisis  filogeneticos  apoyan  el  papel  de  Centroamerica  Nuclear  en  interconectar  la  avifauna  de  America  del  Norte  y  del  Sur.  Ademas,  los  altos  niveles  de  estructura  genetica  poblacional  entre  diferentes  cadenas  montanosas  dentro  de  Centroamerica  Nuclear  sugieren  diversificacion  in  situ.  Mostramos  que  el  efecto  de  aislamiento  que  genera  el  Sistema  de  Fallas  Motagua-Polochic-Jocotan  no  es  homogeneo  en  toda  su  extension  y  que  la  barrera  biogeografica  al  este  de  los  Altos  de  Chiapas  es  fundamental  para  aislar  las  poblaciones  de  aves  de  montana.
■590    ▼aSchool  code:  0028.
■650  4▼aBiology.
■650  4▼aGenetics.
■650  4▼aEcology.
■653    ▼aDiversification
■653    ▼aGenomic  data
■653    ▼aHybridization
■653    ▼aMotagua-Polochic
■653    ▼aPhylogeography
■653    ▼aStructural  coloration
■690    ▼a0306
■690    ▼a0369
■690    ▼a0329
■71020▼aUniversity  of  California,  Berkeley▼bIntegrative  Biology.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g85-04B.
■773    ▼tDissertation  Abstract  International
■790    ▼a0028
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2021
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T16931872▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.
■980    ▼a202402▼f2024

미리보기

내보내기

chatGPT토론

Ai 추천 관련 도서