MARC

 008250123s2024        us                              c    eng  d
■001000017161527
■00520250211151408
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798342103527
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI31285286
■035    ▼a(MiAaPQ)25493446
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a500
■1001  ▼aSaxena,  Roopashi.
■24510▼aExploring  the  Structural  Determinants  of  Ebolavirus  Matrix  Protein  (VP40)  Dimer  Interface:  Biophysical  and  Peptidomimetic  Analysis  of  Dimer  Stability
■260    ▼a[Sl]▼bPurdue  University▼c2024
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2024
■300    ▼a167  p
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  86-04,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Stahelin,  Robert.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--Purdue  University,  2024.
■520    ▼aEbola  virus  is  an  enveloped  filamentous  shaped  RNA  virus  which  causes  severe  hemorrhagic  fever  in  humans.  Multiple  outbreaks  of  different  strains  of  ebolavirus  have  been  reported  in  the  past  years  with  limited  therapeutics  available  for  treatment.  Despite  some  advances  in  treatment,  there  remains  a  lack  of  knowledge  about  the  mechanisms  of  ebolavirus  replication  in  host  cells.Ebolavirus  encodes  for  seven  structural  proteins  with  matrix  protein  (VP40)  being  the  most  abundantly  expressed  viral  protein.  VP40  is  essential  for  viral  assembly  and  budding  as  expression  of  VP40  alone  is  sufficient  for  formation  of  virus-like  particles  (VLPs).  VP40  also  disassembles  during  viral  entry  to  help  in  viral  and  host  cell  membrane  fusion.  Oligomerization  of  VP40  has  been  reported  to  decrease  viral  replication  and  transcription.  VP40  can  perform  these  diverse  functions  by  virtue  of  changes  in  conformation  and  oligomerization  state.  VP40  predominantly  exists  as  a  dimer  through  hydrophobic  interactions  between  the  alpha  helices  of  the  two  protomers.  Furthermore,  VP40  oligomerizes  into  a  hexamer  which  serves  as  the  structural  unit  for  cylindrical  matrix  layer  formation.  VP40  also  forms  a  ring-shaped  octamer  for  regulation  of  viral  transcription.  The  different  oligomeric  forms  of  VP40  exist  in  an  equilibrium  for  successful  viral  infection.  However,  the  exact  mechanism  of  formation,  stability,  and  energetics  of  conversion  between  these  oligomeric  forms  is  unknown.In  this  study,  we  performed  biophysical  analysis  on  the  dimerization  interface  and  identified  keystone  interactions  which  when  abrogated  lead  to  complete  disruption  of  dimer  interface.  In  addition,  peptidomimetics  approach  was  used  to  design  and  synthesize  a  library  of  compounds  to  probe  the  dimerization  interface.  The  compounds  were  screened  using  thermal  shift  assay  and  then  compared  using  MST  and  ITC  studies.  We  identified  that  a  peptide  mimicking  the  alpha  helical  region  stabilized  by  a  p-xylene  di-cysteine  staple  was  able  to  bind  to  VP40  dimer.  We  also  determined  that  this  peptide  binds  near  the  dimer  interface  and  was  able  to  slightly  shift  equilibrium  of  VP40  dimer  towards  monomer  formation.Overall,  this  report  sheds  light  on  critical  interactions  required  for  VP40  dimer  formation  and  stability  and  introduces  use  of  peptidomimetics  to  probe  for  VP40  dimerization  interface  to  understand  energetics  of  oligomerization  equilibrium,  thereby  increasing  our  knowledge  about  disease  mechanism  and  paving  way  for  development  of  therapeutics.
■590    ▼aSchool  code:  0183.
■650  4▼aPlasma
■650  4▼aGlycoproteins
■650  4▼aReagents
■650  4▼aHydrogen  bonds
■650  4▼aMutation
■650  4▼aAmino  acids
■650  4▼aHeat
■650  4▼aGenomes
■650  4▼aEnergy
■650  4▼aChromatography
■650  4▼aMutagenesis
■650  4▼aProtein  expression
■650  4▼aCrystal  structure
■650  4▼aPlasmids
■650  4▼aEpidemics
■650  4▼aViruses
■650  4▼aMolecular  weight
■650  4▼aEbola  virus
■650  4▼aBiophysics
■650  4▼aEpidemiology
■650  4▼aGenetics
■650  4▼aVirology
■690    ▼a0791
■690    ▼a0786
■690    ▼a0766
■690    ▼a0369
■690    ▼a0720
■71020▼aPurdue  University.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g86-04B.
■790    ▼a0183
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2024
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T17161527▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.

미리보기

내보내기

chatGPT토론

Ai 추천 관련 도서