MARC

 008250123s2024        us                              c    eng  d
■001000017160223
■00520250211150937
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798384048275
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI30991144
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a574
■1001  ▼aTsai,  Amy  Wei-Lun.▼0(orcid)0000-0001-8856-617X
■24510▼aStructural  and  Mechanistic  Studies  of  CRISPR-Associated  Transposons
■260    ▼a[Sl]▼bCornell  University▼c2024
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2024
■300    ▼a210  p
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  86-03,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Kellogg,  Elizabeth.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--Cornell  University,  2024.
■520    ▼aCurrent  gene-editing  tools,  including  CRISPR  and  transposon  systems,  serve  various  purposes  for  treating  genetic  diseases.  However,  they  lack  precision  in  inserting  large  DNA  sequences  into  specific  areas  of  interest.  A  novel  class  of  genetic  elements,  CRISPR-associated  transposons  (CAST),  were  recently  discovered  to  be  capable  of  performing  DNA  insertions  via  RNA-guided  transposition.  CASTs  merge  the  precise  targeting  capability  of  CRISPR  systems  with  the  ability  to  transport  large  DNA  cargos  from  transposons,  showing  significant  potential  as  an  innovative  gene  editing  tool.To  realize  the  potential  of  these  novel  CAST  systems,  little  is  known  regarding  how  elements  of  CAST  systems  are  assembled  and  how  those  elements  act  together  to  perform  DNA  integration.  This  thesis  describes  efforts  made  to  structurally  characterize  each  protein  component  from  a  type  V-K  CAST  from  Scytonema  Hofmanni  (ShCAST)  and  to  elucidate  the  underlying  molecular  mechanism  through  a  combination  of  biochemical  studies  and  single-particle  cryogenic-electron  microscopy  (cryo-EM).  Importantly,  the  structure  of  the  transpososome,  an  integration  complex  containing  all  CAST  components,  is  presented  here.  Insights  provided  by  the  structure  of  this  complex  are  used  to  inform  a  comprehensive  mechanistic  model  for  the  activity  of  the  complex,  including  targeting  and  regulation.  The  model  reveals  how  CAST  proteins  collectively  act  as  a  molecular  machine  to  insert  DNA  at  a  genomic  target  site.  The  results  from  this  study  provide  novel  avenues  for  the  rational  optimization  of  CASTs  for  highly  efficient  gene  insertions  with  single  base-pair  resolution,  a  critical  goal  in  the  field  of  gene  therapy.
■590    ▼aSchool  code:  0058.
■650  4▼aBiology
■650  4▼aMolecular  biology
■650  4▼aGenetics
■653    ▼aCRISPR
■653    ▼aCRISPR-associated  transposons
■653    ▼aCryo-EM
■653    ▼aStructural  biology
■653    ▼aTransposons
■690    ▼a0306
■690    ▼a0369
■690    ▼a0307
■71020▼aCornell  University▼bChemistry  and  Chemical  Biology.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g86-03B.
■790    ▼a0058
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2024
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T17160223▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.

Preview

Export

ChatGPT Discussion

AI Recommended Related Books