MARC

 008250123s2024        us                              c    eng  d
■001000017164082
■00520250211152830
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798346571391
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI31560452
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a574
■1001  ▼aLoubet-Senear,  Kaitlyn.▼0(orcid)0000-0003-1340-5253
■24510▼aOld  Questions  and  New  Insights:  A  Comparison  of  Development  and  Regeneration  in  the  Acoel  Worm  Hofstenia  miamia
■260    ▼a[Sl]▼bHarvard  University▼c2024
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2024
■300    ▼a165  p
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  86-05,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Srivastava,  Mansi.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--Harvard  University,  2024.
■520    ▼aDevelopment  and  regeneration  both  result  in  the  formation  of  a  complete  adult  body  plan.  Although  these  processes  have  different  starting  points  -  from  the  single-celled  zygote  during  development  versus  from  the  many  differentiated  cell  types  present  in  a  regenerating  adult  animal  -  they  share  many  key  processes,  e.g.,  the  establishment  of  major  body  axes  and  the  differentiation  of  cellular  lineages.  These  similarities  have  led  to  longstanding  questions  regarding  the  relationship  between  the  two  processes,  and  the  hypothesis  that  regeneration  could  include  redeployment  of  developmental  mechanisms.  This  raises  the  question  of  how  developmental  pathways  are  re-accessed  during  regeneration,  which  further  has  implications  for  understanding  the  evolution  of  regeneration,  and  why  regeneration  may  succeed  or  fail  in  different  taxa.  In  past  studies,  reuse  of  developmental  genes  during  regeneration  has  been  demonstrated  in  multiple  species  by  both  broad  and  specific  process  comparisons.  However,  given  their  distinct  starting  points,  the  mechanisms  allowing  for  the  re-use  of  developmental  processes  during  regeneration  are  active  areas  of  investigation.In  this  dissertation  I  used  the  highly  regenerative  acoel  worm  Hofstenia  miamia  to  conduct  both  broad  and  targeted  investigations  comparing  development  and  regeneration.  In  Chapter  2,  I  produced  a  developmental  ATAC-seq  dataset  that  is  needed  to  assess  regulatory  mechanisms  during  development  relative  to  regeneration.  Using  these  data,  I  investigated  the  regulatory  landscape  of  H.miamia  embryogenesis,  characterizing  large  scale  changes  in  chromatin  accessibility  and  putative  regulators  of  tissue  identity.  In  Chapter  3,  I  undertook  a  thorough  investigation  of  development  and  regeneration  in  H.miamia.  I  compared  transcriptome-wide  gene  expression,  and  similar  to  other  species  found  high  overlap  between  gene  use  in  development  and  regeneration.  However,  the  temporal  order  regarding  when  these  genes  were  expressed  relative  to  one  another  was  different  in  the  two  processes,  consistent  with  other  studies  indicating  that  regeneration  is  not  a  strict  recapitulation  of  development.  Targeted  comparisons  of  key  components  shared  between  regeneration  and  development,  including  cell  specification  and  re-establishment  of  posterior  patterning,  showed  similarities  in  pathway  progression  and  also  revealed  development  and  regeneration-specific  features,  especially  in  the  expression  of  early  pathway  components.  We  further  found  that  the  network  architecture  of  a  wound-response  program  was  likely  a  regeneration-specific  innovation.  Chromatin  accessibility  analyses  suggested  that  similar  regulatory  regions  control  expression  of  shared  genes  in  development  and  regeneration,  regardless  of  similar  or  distinct  expression  patterns,  likely  via  distinct  transcription  factor  binding  sites.  This  was  even  true  of  wound-induce  genes,  which  have  been  postulated  in  other  systems  to  be  controlled  by  distinct  regulatory  elements.  These  findings  provide  new  resolution  as  to  how  developmental  processes  could  be  reactivated  in  response  to  wounding.  Furthermore,  this  study  represents  the  first  such  comparison  of  development  and  regeneration  in  Xenacoelmorpha,  an  enigmatic  phylum  placed  either  as  sister  to  Ambulacraria  or  to  other  bilaterians.  The  tools  I  utilized  to  conduct  these  investigations  are  applicable  to  new  research  organisms,  opening  the  door  to  similar  comparisons  in  an  even  broader  range  of  organisms.
■590    ▼aSchool  code:  0084.
■650  4▼aDevelopmental  biology
■650  4▼aEvolution  &  development
■650  4▼aBiology
■650  4▼aCellular  biology
■650  4▼aGenetics
■653    ▼aAcoel
■653    ▼aCell  fate  specification
■653    ▼aChromatin  profiling
■653    ▼aDevelopmental  genes  
■653    ▼aPatterning
■653    ▼aRegeneration
■690    ▼a0758
■690    ▼a0412
■690    ▼a0306
■690    ▼a0379
■690    ▼a0369
■71020▼aHarvard  University▼bBiology,  Molecular  and  Cellular.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g86-05B.
■790    ▼a0084
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2024
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T17164082▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.

Preview

Export

ChatGPT Discussion

AI Recommended Related Books