MARC

 008250123s2024        us                              c    eng  d
■001000017162719
■00520250211152046
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798384025092
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI31337354
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a575
■1001  ▼aPeng,  Felicia.
■24510▼aMeasuring  Messenger  RNA  Stability  Across  Developmental  Stages  and  Cell  Types  Throughout  Embryogenesis
■260    ▼a[Sl]▼bUniversity  of  Pennsylvania▼c2024
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2024
■300    ▼a122  p
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  86-02,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Murray,  John  I.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--University  of  Pennsylvania,  2024.
■520    ▼aDuring  embryonic  development,  cells  undergo  dynamic  changes  in  gene  expression  that  are  required  for  appropriate  cell  fate  specification.  Although  both  transcription  and  mRNA  degradation  contribute  to  gene  expression  dynamics,  patterns  of  mRNA  decay  are  less  well-understood.  Here  we  directly  measured  spatiotemporally  resolved  mRNA  decay  rates  transcriptome-wide  throughout  C.  elegans  embryogenesis  by  transcription  inhibition  followed  by  bulk  and  single-cell  RNA-sequencing.  This  allowed  us  to  calculate  mRNA  half-lives  within  specific  cell  types  and  developmental  stages  and  identify  differentially  regulated  mRNA  decay  throughout  embryonic  development.  We  identified  transcript  features  that  are  correlated  with  mRNA  stability  and  found  that  mRNA  decay  rates  are  associated  with  distinct  peaks  in  gene  expression  over  time.  Moreover,  we  provide  evidence  that,  on  average,  mRNA  is  more  stable  in  the  germline  compared  to  in  the  soma  and  in  later  embryonic  stages  compared  to  in  earlier  stages.  This  work  suggests  that  differential  mRNA  decay  across  cell  states  and  time  helps  to  shape  developmental  gene  expression,  and  it  provides  a  valuable  resource  for  studies  of  mRNA  turnover  regulatory  mechanisms.
■590    ▼aSchool  code:  0175.
■650  4▼aGenetics
■650  4▼aCellular  biology
■650  4▼aMolecular  biology
■650  4▼aDevelopmental  biology
■653    ▼amRNA  decay
■653    ▼aDevelopmental  stages
■653    ▼aEmbryogenesis
■653    ▼aEmbryonic  development
■653    ▼aCell  types
■690    ▼a0369
■690    ▼a0379
■690    ▼a0758
■690    ▼a0307
■71020▼aUniversity  of  Pennsylvania▼bCell  and  Molecular  Biology.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g86-02B.
■790    ▼a0175
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2024
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T17162719▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.

Preview

Export

ChatGPT Discussion

AI Recommended Related Books