MARC

 008250123s2024        us                              c    eng  d
■001000017160874
■00520250211151129
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798382781945
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI31147451
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a574
■1001  ▼aLiu,  Weihan.▼0(orcid)0000-0002-1023-7955
■24510▼aThe  Epigenetic  Regulation  Mechanism  of  CUX1  in  Hematopoiesis
■260    ▼a[Sl]▼bThe  University  of  Chicago▼c2024
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2024
■300    ▼a184  p
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  85-12,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  McNerney,  Megan.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--The  University  of  Chicago,  2024.
■520    ▼aThis  three-parts  thesis  presents  discovery  of  the  molecular  mechanisms  underpinning  hematopoiesis  and  its  dysregulation  in  cancer.  Identifying  tumor  suppressor  genes  on  chromosome  regions  affected  by  aneuploidy  has  been  historically  challenging  due  to  the  large  number  of  genes  involved.  The  first  part  of  the  thesis  leveraged  published  genome-wide  perturbation  screen  data  and  advancement  in  machine  learning  algorithms  in  recent  years.  This  work  led  to  a  supervised  machine  learning  workflow  that  systemically  predicted  the  tumor  suppressor  gene-like  activities  for  all  chromosome  7  genes.  The  second  and  third  parts  focus  on  the  multifaceted  roles  of  CUX1  as  a  pioneer  transcription  factor.  CUX1  is  a  homeodomain-containing  transcription  factor  (TF)  that  is  essential  for  development  and  differentiation  of  multiple  tissues.  CUX1  is  recurrently  mutated  or  deleted  in  cancer,  particularly  in  myeloid  malignancies.  However,  the  mechanisms  by  which  CUX1  regulates  gene  expression  and  differentiation  remain  poorly  understood,  creating  a  barrier  to  understanding  the  tumor  suppressive  functions  of  CUX1.  Herein,  we  demonstrate  that  CUX1  directs  the  BAF  chromatin  remodeling  complex  to  DNA  to  increase  DNA  accessibility  in  hematopoietic  cells.  CUX1  preferentially  regulates  lineage-specific  enhancers,  and  CUX1  target  genes  are  predictive  of  cell  fate  in  vivo.  Moreover,  the  thesis  illuminates  the  intricate  relationship  between  CUX1  and  GATA1,  two  key  regulators  in  erythropoiesis.  In  erythroid  differentiation,  CUX1  dynamically  shifts  binding  targets  from  hematopoietic  stem  cell  (HSC)  -specific  enhancers  to  erythroid  specific  enhancers  co-bound  by  GATA1.  CUX1  gatekeeps  GATA1  from  abnormal  and  promiscuous  binding  by  direct  physical  shielding  and  indirect  mechanisms.  These  data  indicate  that  CUX1  possesses  pioneer  factor  activities  to  epigenetically  regulate  hematopoietic  lineage  commitment  and  homeostasis.  CUX1  deficiency  disrupts  these  processes  in  stem  and  progenitor  cells,  facilitating  transformation.  In  the  erythroid  branch  of  hematopoiesis,  CUX1  promotes  healthy  differentiation  through  ensuring  proper  GATA1  binding.  By  bridging  molecular  insights  from  aneuploidy,  CUX1  epigenetic  regulatory  mechanisms,  and  CUX1-GATA1  interaction,  this  thesis  provides  novel  insights  of  the  molecular  machinery  governing  hematopoiesis  and  offers  novel  perspectives  on  cancer  biology  and  treatment  strategies.
■590    ▼aSchool  code:  0330.
■650  4▼aBiology
■650  4▼aBioinformatics
■650  4▼aCellular  biology
■650  4▼aOncology
■653    ▼aCancer
■653    ▼aCell  fate
■653    ▼aEpegenetics
■653    ▼aPioneer  factor
■653    ▼aStem  cells
■653    ▼aTranscription  factor
■690    ▼a0306
■690    ▼a0715
■690    ▼a0379
■690    ▼a0992
■71020▼aThe  University  of  Chicago▼bCancer  Biology.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g85-12B.
■790    ▼a0330
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2024
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T17160874▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.

Preview

Export

ChatGPT Discussion

AI Recommended Related Books