MARC

 008250123s2024        us                              c    eng  d
■001000017161154
■00520250211151317
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798382812212
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI31238651
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a574
■1001  ▼aTakagishi,  Seesha.▼0(orcid)0000-0001-7842-7889
■24510▼aDissecting  the  Combinatorial  Dynamics  of  NFAT  Transcription  Factors  During  IgE-Mediated  Mast  Cell  Activation
■260    ▼a[Sl]▼bUniversity  of  California,  San  Francisco▼c2024
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2024
■300    ▼a60  p
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  85-12,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Weiner,  Orion.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--University  of  California,  San  Francisco,  2024.
■520    ▼aAlthough  there  are  many  environmental  stimuli  and  possible  cellular  responses,  there  are  a  finite  number  of  transcription  factors  (TFs)  in  the  cell  to  coordinate  these  responses.  One  way  the  information  carrying  capacity  of  a  single  signal  is  multiplexed  is  through  the  combinatorial  effect  of  TFs,  where  two  or  more  inputs  modulate  the  expression  of  a  single  gene.  Functionally,  it  has  been  hypothesized  that  these  combinatorial  dynamics  are  utilized  by  cells  to  fine  tune  cellular  responses,  such  as  with  the  NFAT  TFs  and  the  immune  response.  NFAT  (nuclear  factor  of  activated  t-cells)  activity  is  regulated  both  physically  and  temporally.  Physically,  NFAT  is  known  to  bind  several  cofactors  that  modulate  the  subsequent  transcriptional  response.  Temporally,  NFAT  isoforms  are  known  to  have  divergent  nuclear  translocation  responses  to  the  same  environmental  stimulus.  Additionally,  a  single  environmental  stimulus  could  activate  several  pathways  simultaneously,  such  as  the  case  with  NFAT  and  NFkB,  which  are  both  known  to  behave  dynamically.  Here,  we  leverage  an  epistasis  experimental  strategy  and  optogenetics  to  dissect  combinatorial  gene  regulation  involving  NFAT1.  We  replicate  the  sustained  nuclear  translocation  of  NFAT1  and  pulsatile  nuclear  translocation  of  NFAT4  in  response  to  IgE-mediated  mast  cell  activation  in  the  mast  model  cell  line  RBL-2H3.  For  the  first  time,  we  showed  that  IgE  antigen  stimulation  results  in  many  transcriptional  changes,  of  which  only  a  subset  are  NFAT1  or  NFAT4  specific.  We  demonstrated  that  there  are  distinct  and  overlapping  roles  of  NFAT1  and  NFAT4  in  the  IgE  antigen  transcriptional  response,  and  this  response  involves  other  factors.  We  used  the  optogenetic  tool  CLASP  (Controllable  Light  Activated  Shuttling  and  Plasma  membrane  sequestration)  for  NFAT1  and  successfully  controlled  NFAT1  nuclear  translocation  with  diverse  blue  light  inputs.  We  found  that  blue  light  alone  produced  significant  transcriptional  activity  in  our  cells  of  interest,  but  also  found  that  NFAT1-CLASP  produced  specific  NFAT1-like  effects  upon  light-induced  translocation.  Overall,  we  identified  the  NFAT  specific  signaling  downstream  of  IgE  stimulation  and  demonstrated  a  system  capable  of  dissecting  the  information  encoded  in  NFAT1  nuclear  translocation  dynamics.
■590    ▼aSchool  code:  0034.
■650  4▼aMolecular  biology
■650  4▼aSystematic  biology
■650  4▼aCellular  biology
■650  4▼aBiochemistry
■653    ▼aCombinatorial  dynamics
■653    ▼aOptogenetics
■653    ▼aTranscription  factors
■653    ▼aTranslocation  dynamics
■653    ▼aCell  activation
■690    ▼a0307
■690    ▼a0423
■690    ▼a0379
■690    ▼a0487
■71020▼aUniversity  of  California,  San  Francisco▼bBiochemistry  and  Molecular  Biology.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g85-12B.
■790    ▼a0034
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2024
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T17161154▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.

Preview

Export

ChatGPT Discussion

AI Recommended Related Books