MARC

 008260126s2025        us                              c    eng  d
■001000017359250
■00520260202104855
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798288814808
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI32201008
■035    ▼a(MiAaPQ)Stanfordvx359zb0057
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a612
■1001  ▼aDeFeo,  Mary  E.
■24510▼aAnaerobic  IAA  Production  and  Its  Metabolic  Impact  in  Select  Acetogenic  Gut  Bacteria
■260    ▼a[Sl]▼bStanford  University▼c2025
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2025
■300    ▼a184  p
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  87-02,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Dodd,  Dylan.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--Stanford  University,  2025.
■520    ▼aIndoleacetic  acid  (IAA),  a  gut  bacterial  tryptophan  metabolite,  is  known  for  its  ability  to  modulate  host  immunity  by  engaging  the  aryl-hydrocarbon  receptor  and  is  negatively  associated  with  numerous  diseases.  Despite  its  significant  therapeutic  potential,  anaerobic  IAA  production  in  the  human  gut  is  undefined.  This  dissertation  outlines  efforts  to  investigate  the  enzymatic  pathway  responsible  for  anaerobic  IAA  production  and  its  metabolic  impact  on  select  gut  bacteria.  In  chapter  2,  we  identify  gut  bacteria  that  robustly  produce  IAA  under  anaerobic  conditions.  Our  screen  revealed  that  these  microbes  also  produce  end  products  from  the  oxidative  metabolism  of  other  aromatic  and  branched-chain  amino  acids,  which  have  been  shown  in  other  organisms  to  require  the  activity  of  2-oxoacid:ferredoxin  oxidoreductases  (OFORs).  Using  heterologous  overexpression  in  E.  coli,  we  biochemically  characterize  an  enzymatic  pathway  that  is  sufficient  for  anaerobic  IAA  production  and  includes  an  OFOR.  Because  the  OFOR  enzyme  family  can  act  on  a  wide  range  of  substrates,  in  Chapter  3,  we  used  enzyme  assays  to  measure  the  specific  activity  of  13  previously  uncharacterized  OFOR  enzymes  in  these  IAA  producers  against  a  panel  of  substrates.  We  also  investigate  how  enzyme  structure,  particularly  in  the  active  site,  may  contribute  to  this  diverse  substrate  activity.  In  chapter  4,  we  explore  how  IAA  production  impacts  cellular  physiology  in  IAA  producers,  and  using  stable  isotope  tracing,  we  reveal  a  link  between  tryptophan  oxidation  into  IAA  and  carbon  fixation.  Finally,  in  chapter  5,  we  outline  attempts  to  develop  genetic  systems  for  targeted  mutagenesis  in  these  non-model  gut  bacteria.  Collectively,  this  work  contributes  mechanistic  insights  into  the  production  of  IAA  and  other  health-modifying  microbial  metabolites  and  furthers  our  understanding  of  key  metabolic  processes  that  underlie  bacterial  physiology  in  the  gut.
■590    ▼aSchool  code:  0212.
■650  4▼aPhysiology
■650  4▼aPathogens
■650  4▼aHydrocarbons
■650  4▼aDisease
■650  4▼aBacteria
■650  4▼aEarth
■650  4▼aUrine
■650  4▼aAmino  acids
■650  4▼aDiet
■650  4▼aEnergy
■650  4▼aMetabolism
■650  4▼aProtein  synthesis
■650  4▼aCells
■650  4▼aOxidation
■650  4▼aLiver
■650  4▼aAntibiotics
■650  4▼aCarbon
■650  4▼aGlucose
■650  4▼aVeins  &  arteries
■650  4▼aMetabolites
■650  4▼aProteomics
■650  4▼aMicrobiology
■650  4▼aImmunology
■653    ▼aIndoleacetic  acid
■653    ▼aOxoacid:ferredoxin  oxidoreductases
■653    ▼aGut  bacteria
■690    ▼a0791
■690    ▼a0719
■690    ▼a0982
■690    ▼a0410
■71020▼aStanford  University.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g87-02B.
■790    ▼a0212
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2025
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T17359250▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.

미리보기

내보내기

chatGPT토론

Ai 추천 관련 도서