MARC

 008260126s2024        us                              c    eng  d
■001000017358720
■00520260202104742
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798290651880
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI32149713
■035    ▼a(MiAaPQ)Stanfordrm650gk9150
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a500
■1001  ▼aAtsavapranee,  Beatriz  Shue-Yi.
■24510▼aRevealing  Kinetics  of  Protein  Unfolding  with  a  High-Throughput  Microfluidic  Platform
■260    ▼a[Sl]▼bStanford  University▼c2024
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2024
■300    ▼a145  p
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  87-01,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Fordyce,  Polly.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--Stanford  University,  2024.
■520    ▼aProteins  underpin  a  vast  number  of  essential  functions  in  the  cell.  To  perform  these  diverse  roles,  proteins  must  fold  from  a  linear  chain  of  amino  acids  into  a  three-dimensional  structure.  Even  after  reaching  this  state,  proteins  repeatedly  sample  other  conformations,  where  thermodynamics  and  kinetics  determine  the  probability  and  rate  of  each  transition.  Quantitatively  mapping  the  physical  parameters  that  dictate  protein  stability  is  therefore  critical  to  predict  how  mutations  impact  function  in  disease  and  inform  the  design  of  proteins  with  desired  functions.  This  thesis  explores  the  development  and  application  of  approaches  to  quantify  thermodynamic  stability  at  various  scales.  Beyond  thermodynamic  stability,  kinetic  stability  is  essential  for  proteins  to  maintain  their  native  conformation  over  biologically  relevant  timescales.  Despite  this  critical  role,  we  lack  systematic  measurements  of  protein  kinetic  stability,  which  are  necessary  to  understand  how  changes  in  sequence  impact  the  abundance  and  lifetime  of  proteins.  To  address  this  challenge,  we  introduce  SPARKfold  (Simultaneous  Proteolysis  Assay  Revealing  Kinetics  of  Folding),  a  high-throughput  microfluidic  assay  for  measuring  protein  kinetic  stability.  By  studying  dihydrofolate  reductase  (DHFR),  we  demonstrate  that  SPARKfold  can  capture  subtle  variations  in  unfolding  rates  across  a  wide  dynamic  range,  revealing  how  changes  in  protein  sequence  alter  kinetic  stability.  SPARKfold  enables  systematic  studies  of  diverse  protein  systems  and  variants,  providing  a  powerful  tool  for  uncovering  the  determinants  of  kinetic  stability.  In  the  future,  this  versatile  platform  promises  to  address  both  fundamental  questions  and  practical  challenges  in  protein  science,  from  unraveling  the  role  of  kinetic  stability  in  cellular  function  to  exploring  the  design  of  hyperstable  proteins  for  industrial  use.  By  providing  a  framework  for  integrating  thermodynamic  and  kinetic  measurements,  this  work  advances  our  understanding  of  protein  stability  while  informing  future  efforts  to  explore  and  engineer  folding  and  function.
■590    ▼aSchool  code:  0212.
■650  4▼aNeurodegeneration
■650  4▼aDihydrofolate  reductase
■650  4▼aProtein  folding
■650  4▼aThermodynamics
■650  4▼aBioinformatics
■650  4▼aDisease
■650  4▼aBiochemistry
■650  4▼aMutation
■650  4▼aLife  sciences
■650  4▼aChemistry
■650  4▼aAmino  acids
■650  4▼aAmyotrophic  lateral  sclerosis
■650  4▼aNeurosciences
■650  4▼aBiology
■650  4▼aEnergy
■650  4▼aHomeostasis
■650  4▼aBioengineering
■650  4▼aKinetics
■690    ▼a0791
■690    ▼a0202
■690    ▼a0487
■690    ▼a0306
■690    ▼a0348
■690    ▼a0485
■690    ▼a0317
■690    ▼a0715
■71020▼aStanford  University.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g87-01B.
■790    ▼a0212
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2024
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T17358720▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.

미리보기

내보내기

chatGPT토론

Ai 추천 관련 도서