MARC

 008260126s2025        us                              c    eng  d
■001000017358768
■00520260202104749
■006m          o    d                
■007cr#unu||||||||
■020    ▼a9798290652931
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI32151320
■035    ▼a(MiAaPQ)Caltech17219
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a591
■1001  ▼aChakravorty,  Arun.
■24510▼aBridging  Space  and  Time:  Resolving  the  Temporal  Dynamics  of  the  Seminiferous  Epithelial  Cycle  Using  Spatial  Transcriptomics
■260    ▼a[Sl]▼bCalifornia  Institute  of  Technology▼c2025
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2025
■300    ▼a131  p
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  87-01,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Cai,  Long.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--California  Institute  of  Technology,  2025.
■520    ▼aBiology  is  inherently  spatial,  with  tissue  architecture  and  cell-cell  interactions  shaping  dynamic  developmental  and  homeostatic  processes.  In  this  thesis,  we  harness  high-resolution  spatial  transcriptomics  via  RNA  seqFISH+  to  show  how  spatial  information  can  be  used  to  resolve  temporal  information  in  complex  tissues,  using  adult  mouse  spermatogenesis  as  a  model.  By  profiling  2,638  genes  in  over  216,000  cells,  we  find  that  each  seminiferous  tubule  cross-section  represents  a  distinct  timepoint  of  the  seminiferous  epithelial  cycle,  and  collectively  all  tubules  form  a  circular  topology  in  gene  expression  space  that  precisely  aligns  with  the  known  12-stage  progression.  Intriguingly,  Sertoli  cells  exhibit  a  robust  cyclic  transcriptional  program  synchronized  with  germ  cell  differentiation,  raising  the  question  of  whether  this  cycle  is  driven  solely  by  germ  cells  or  whether  Sertoli  cells  display  an  intrinsic  cyclic  expression  profile.  To  address  this,  we  ablate  differentiating  germ  cells  using  a  DNA  alkylating  agent,  busulfan.  In  this  model,  despite  the  lack  of  differentiating  germ  cells,  Sertoli  cells  maintain  much  of  their  cyclic  expression  suggesting  an  autonomous  cycle  that  partially  dephases  without  germ  cell  input.  Integrative  analyses  suggest  that  the  underlying  mechanism  of  this  oscillation  may  involve  an  innate  retinoic  acid  metabolic  cycle  and/or  an  interconnected  transcription  factor  network.  Finally,  we  discuss  how  these  findings  broaden  our  understanding  of  tissue  processes  and  propose  that  spatial  transcriptomics  can  be  adopted  to  reconstruct  temporal  dynamics  for  many  tissues  from  static  snapshots.
■590    ▼aSchool  code:  0037.
■650  4▼aEmbryos
■650  4▼aGene  expression
■650  4▼aBar  codes
■650  4▼aSpermatogenesis
■650  4▼aHybridization
■650  4▼aInsects
■650  4▼aBiology
■650  4▼aGenomics
■650  4▼aStem  cells
■650  4▼aGeometry
■650  4▼aMorphology
■650  4▼aCell  division
■690    ▼a0287
■690    ▼a0306
■690    ▼a0729
■71020▼aCalifornia  Institute  of  Technology▼bBiology  and  Biological  Engineering.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g87-01B.
■790    ▼a0037
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2025
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T17358768▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.

미리보기

내보내기

chatGPT토론

Ai 추천 관련 도서