MARC

 008260126s2025        us                              c    eng  d
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■020    ▼a9798290657035
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI32151341
■035    ▼a(MiAaPQ)Caltech17274
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■0820  ▼a600
■1001  ▼aNarayanan,  Aditi  Kalpagam.
■24510▼aDiversity,  Activity,  and  Adaptations  of  Phage  Communities  in  Anoxic  Hydrocarbon-Rich  Marine  Sediments
■260    ▼a[Sl]▼bCalifornia  Institute  of  Technology▼c2025
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2025
■300    ▼a169  p
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  87-01,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  Orphan,  Victoria.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--California  Institute  of  Technology,  2025.
■520    ▼aThe  viruses  of  the  global  ocean,  especially  those  infecting  prokaryotic  taxa,  are  known  to  play  an  important  role  in  maintaining  the  genetic  and  taxonomic  diversity  of  their  host  communities  and  in  the  cycling  of  atmospheric  carbon  and  key  nutrients  like  nitrogen  and  iron.  However,  the  vast  majority  of  these  conclusions  are  drawn  from  the  surface  ocean  and  upper  water  column,  while  the  sediments,  which  constitute  one  of  the  largest  biomes  on  earth,  are  understudied  in  comparison.  Of  special  interest  are  areas  on  the  ocean  floor  where  methane  and  other  hydrocarbons  are  produced  and  released  by  geological  activity  and  oxidized  by  a  consortium  of  archaea  and  bacteria.  Using  direct  genomic  sequencing  of  the  viruses  from  a  variety  of  simplified  sediment-free  enrichments  of  hydrocarbon  oxidizers,  I  compare  viral  communities  sampled  from  different  locations  and  incubated  under  a  range  of  temperatures  to  understand  the  role  these  parameters  might  play  in  shaping  distribution  and  community  structure.  I  then  present  the  most  comprehensive  picture  thus  far  of  viral  diversity  and  distribution  from  a  methane  cold  seep  and  discuss  whether  the  viral  assemblages  are  influenced  by  the  steep  geochemical  gradients  that  characterize  seep  sediments.  From  these  datasets,  I  propose  that  viral  communities  in  methane-oxidizing  sediments  are  tailored  specifically  to  the  physical  constraints  of  the  sediment  matrix  rather  than  to  the  dominant  members  of  the  cellular  community  or  to  other  physicochemical  parameters  such  as  temperature,  sampling  location,  or  depth  below  the  seafloor.  I  then  outline  the  development  of  two  methods,  stable-isotope  probing  coupled  to  nanoSIMS  and  biorthogonal  non-canonical  amino  acid  tagging,  to  work  in  heterogenous  sediment  virus  samples  rather  than  the  liquid  pure  cultures  on  which  they  had  previously  relied.  Implementation  of  these  methods,  which  allow  us  to  temporally  constrain  viral  production  and  virus-influenced  nutrient  flow,  resulted  in  the  hypothesis  that  viral  production  likely  responds  to  shifts  in  the  major  metabolic  processes  within  an  ecosystem  and  may  influence  cellular  community  composition.
■590    ▼aSchool  code:  0037.
■650  4▼aInfections
■650  4▼aHydrocarbons
■650  4▼aChemical  reactions
■650  4▼aMethane
■650  4▼aBacteria
■650  4▼aGenomes
■650  4▼aEnergy
■650  4▼aMetabolism
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■650  4▼aNitrogen
■650  4▼aGeology
■650  4▼aEcology
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■650  4▼aViral  infections
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■650  4▼aMetabolites
■650  4▼aLifestyles
■690    ▼a0372
■690    ▼a0791
■690    ▼a0329
■71020▼aCalifornia  Institute  of  Technology▼bBiology  and  Biological  Engineering.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g87-01B.
■790    ▼a0037
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2025
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T17358782▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.

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